Fosele septice trebuie evacuate la intervale de timp regulate pentru a evita umplerea și avarierea acestora. Curățarea foselor septice este o activitate ce trebuie să folosească echipament profesional pentru a asigura o curățare cât mai corectă a acestora. Pe lângă curățarea foselor septice echipa de instalatori ar trebui să efectueze și desfundarea coloanelor de scurgere către fosele septice.
Vidanjarea se face în funcție de modul/intensitatea de utilizare o dată la 6-12 luni, dar nu mai târziu de 4 ani. După vidanjare fosa nu trebuie dezinfectată și nu trebuie umplută imediat cu apă. Deasemenea fosa septică nu se vidanjează total. Este indicat să se păstreze 10% din nămolul fosei pentru a asigura reluarea procesului de digestie anaeroba de către microorganisme. Astfel procesul de descompunere va începe rapid.